More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2391 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 478 aa  953    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  69.98 
 
 		 482 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  67.27 
 
 		 480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  66.52 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  59.07 
 
 		 487 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  55.4 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  55.01 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  59.35 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  54.13 
 
 		 518 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  59.02 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  56.33 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  56.07 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  49 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  51.4 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  50.47 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  50 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  50 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  50.49 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  48.39 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  47.01 
 
 		 414 aa  286  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  34.86 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  33.11 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  37.15 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.7 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.04 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  31.35 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  31.64 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  33.65 
 
 		 460 aa  210  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.31 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  39.34 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  33.42 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  35.79 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.62 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.73 
 
 		 419 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.1 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.4 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.75 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.62 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.9 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.83 
 
 		 896 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.62 
 
 		 608 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  36.19 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.8 
 
 		 630 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.98 
 
 		 679 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.24 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.38 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.7 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.97 
 
 		 415 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  34.32 
 
 		 688 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.37 
 
 		 650 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.83 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  34.05 
 
 		 666 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2851  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.81 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  33.59 
 
 		 682 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.48 
 
 		 641 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.08 
 
 		 666 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  34.18 
 
 		 405 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.81 
 
 		 604 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.81 
 
 		 604 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.57 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.79 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  35.47 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.73 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.26 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.47 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.47 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.82 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.68 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.59 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.95 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  34.37 
 
 		 879 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.08 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.26 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.47 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.69 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.85 
 
 		 425 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2340  aminotransferase class V  37.38 
 
 		 421 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0193219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 429 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  33.51 
 
 		 661 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.81 
 
 		 673 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.51 
 
 		 407 aa  189  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  31.95 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.96 
 
 		 672 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.96 
 
 		 674 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.84 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.69 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  32.84 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.02 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  32.5 
 
 		 626 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  30.61 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  35.51 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.94 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  35.77 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>