More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0540 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.32 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  78.02 
 
 		 183 aa  291  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.53 
 
 		 183 aa  289  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.92 
 
 		 183 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  71.04 
 
 		 184 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  69.95 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  73.91 
 
 		 184 aa  276  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.58 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  68.31 
 
 		 184 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  68.31 
 
 		 184 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.95 
 
 		 184 aa  264  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  68.97 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  67.76 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  71.04 
 
 		 184 aa  262  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  71.26 
 
 		 216 aa  260  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  67.98 
 
 		 185 aa  256  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  67.23 
 
 		 182 aa  253  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  67.22 
 
 		 199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.05 
 
 		 226 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  65.34 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  66.86 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.42 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  65.34 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  69.57 
 
 		 182 aa  245  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.54 
 
 		 181 aa  245  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  67.47 
 
 		 264 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  65.91 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.75 
 
 		 183 aa  241  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  65.91 
 
 		 226 aa  239  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.72 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  65.56 
 
 		 167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 		 174 aa  217  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  64.9 
 
 		 167 aa  217  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  67.61 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  60.61 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  65.28 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  65.28 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 		 200 aa  204  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.58 
 
 		 200 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.72 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  54.04 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.04 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  58.62 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.21 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.04 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.42 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.09 
 
 		 170 aa  194  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  55.7 
 
 		 268 aa  193  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  55.7 
 
 		 268 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.84 
 
 		 169 aa  191  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  53.74 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 182 aa  190  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.33 
 
 		 794 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  52.15 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  53.21 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  53.21 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.31 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  63.04 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.67 
 
 		 794 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 264 aa  187  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  59.15 
 
 		 173 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.33 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.45 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.76 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  56.82 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.66 
 
 		 793 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  50.31 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  57.75 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  54.86 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  54.3 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>