More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2515 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 
195 aa  121  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
214 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
200 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 
189 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 
195 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 
196 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
197 aa  92  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.62 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  31.63 
 
 
199 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
196 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  33.96 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
447 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.08 
 
 
442 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.8 
 
 
442 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.24 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.24 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.38 
 
 
442 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.08 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.71 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  28.1 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
448 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.52 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.81 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  40.95 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  40.95 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.66 
 
 
442 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.07 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.68 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.28 
 
 
449 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
243 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.07 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
447 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 
225 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.51 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>