More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3192 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 329 aa  656    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.81 
 
 		 328 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.29 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.77 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.24 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  27.31 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  27.05 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.42 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.78 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  26.21 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 352 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.67 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  31.18 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  25.89 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  26.42 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  28.35 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.68 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  27.67 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  26.72 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  29.53 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  27.27 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.08 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  34.39 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  33.86 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  27.27 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  33.86 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  35.94 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  34.39 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  29.41 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.86 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  26.69 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  34.36 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.08 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.37 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  25.49 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  24.37 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  27.84 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.02 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.23 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.15 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.4 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.44 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 694 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.63 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.29 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.56 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  29.41 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.46 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  28.74 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.61 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.1 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.32 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.18 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.77 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.51 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.48 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>