More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2650 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
338 aa  669    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.35 
 
 
344 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.732216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0631  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.64 
 
 
331 aa  396  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.40027  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.98 
 
 
321 aa  326  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0614092  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
300 aa  162  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00399019  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
307 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.967174  normal  0.292641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.85908 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
313 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.355645  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  29.49 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.85 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.85 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.85 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.85 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  28.85 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  28.53 
 
 
310 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
317 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  28.53 
 
 
310 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
316 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.71 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 
307 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
353 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
307 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 
304 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
426 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
304 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  28.67 
 
 
312 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
294 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
321 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
316 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
301 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
291 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.476032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
359 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0201633  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
319 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198584  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  28.79 
 
 
312 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
310 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
309 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  24.92 
 
 
328 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.93 
 
 
294 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 
312 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
323 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
294 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 
337 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
315 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
308 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  24.49 
 
 
311 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
345 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
309 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
316 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
310 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
306 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.5 
 
 
584 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
577 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  30.61 
 
 
525 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1088  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  28.06 
 
 
288 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  hitchhiker  0.00755847 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
577 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
297 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
313 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.85 
 
 
315 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.511569  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
297 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
300 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 
310 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
426 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
262 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
313 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  30.65 
 
 
311 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
296 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  25.85 
 
 
301 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
299 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  28.77 
 
 
536 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.95 
 
 
312 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  28.72 
 
 
318 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
294 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 
288 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
338 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.85 
 
 
422 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.85 
 
 
422 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
291 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.92 
 
 
310 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.08 
 
 
275 aa  99.4  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  26.75 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
329 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  26.76 
 
 
534 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>