More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0831 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  100 
 
 
536 aa  1068    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.5 
 
 
535 aa  638    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.96 
 
 
510 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3326  maltose transporter membrane protein  57.48 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  46.98 
 
 
525 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  48.7 
 
 
518 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12280  permease component of ABC-type sugar transporter  44.87 
 
 
525 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.03304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
557 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
531 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  44.07 
 
 
506 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  41.02 
 
 
535 aa  359  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  41.02 
 
 
534 aa  356  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  43.39 
 
 
544 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  38.17 
 
 
541 aa  345  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
546 aa  336  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  41.05 
 
 
534 aa  331  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  39.96 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
584 aa  283  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
505 aa  279  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  40.13 
 
 
541 aa  266  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
575 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
568 aa  259  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
577 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
577 aa  259  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  35.58 
 
 
515 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
587 aa  250  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  35.88 
 
 
524 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  35.02 
 
 
524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  31.82 
 
 
525 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  31.82 
 
 
525 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  31.82 
 
 
525 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  32.24 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  32.24 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  32.01 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.686373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  32.24 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  32.24 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  32.24 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  32.24 
 
 
514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  32.04 
 
 
514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  32.25 
 
 
514 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  31.52 
 
 
525 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  34.1 
 
 
520 aa  233  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
622 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
577 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  32.35 
 
 
514 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
577 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  32.14 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  32.14 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  32.14 
 
 
514 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  40.94 
 
 
514 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
436 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
321 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  39.06 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  39.06 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
433 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 
433 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 
433 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  39.06 
 
 
433 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  39.06 
 
 
433 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
433 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
433 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
426 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
474 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
426 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
302 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  35.77 
 
 
451 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
569 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.08 
 
 
569 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
309 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
434 aa  163  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
434 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
422 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
422 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
442 aa  161  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 
468 aa  160  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 
317 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
321 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  34.38 
 
 
435 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
435 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  34.38 
 
 
435 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
317 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
451 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
450 aa  156  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
672 aa  154  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
305 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.62 
 
 
317 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1442  maltose ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
456 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00962141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  36.02 
 
 
470 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
337 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
676 aa  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  35.38 
 
 
464 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0220  ABC-type sugar transport system, permease component  34.02 
 
 
451 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000665755  hitchhiker  0.00000000142762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
312 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  37.25 
 
 
452 aa  143  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>