More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4495 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  99.81 
 
 		 514 aa  1041    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  99.81 
 
 		 514 aa  1041    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  100 
 
 		 514 aa  1043    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  90.66 
 
 		 514 aa  911    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  90.47 
 
 		 514 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  99.81 
 
 		 514 aa  1041    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  99.61 
 
 		 514 aa  1038    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  99.81 
 
 		 514 aa  1041    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  99.81 
 
 		 514 aa  1041    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  90.86 
 
 		 514 aa  913    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  90.86 
 
 		 514 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  77.04 
 
 		 525 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  75.44 
 
 		 525 aa  810    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  75.44 
 
 		 525 aa  812    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  90.66 
 
 		 514 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  88.52 
 
 		 514 aa  920    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.686373 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  75.44 
 
 		 525 aa  810    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  99.81 
 
 		 514 aa  1041    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  62 
 
 		 524 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  58.73 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  58.28 
 
 		 524 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  54.6 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.15 
 
 		 622 aa  362  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 		 505 aa  296  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 		 587 aa  287  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.7 
 
 		 577 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  33.59 
 
 		 541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  35.59 
 
 		 534 aa  273  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  34.45 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 		 568 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  33.27 
 
 		 535 aa  266  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  33.27 
 
 		 534 aa  256  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 		 584 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  34.18 
 
 		 546 aa  246  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 		 531 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  34.7 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  32.38 
 
 		 518 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12280  permease component of ABC-type sugar transporter  33.4 
 
 		 525 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.03304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  33.85 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  44.28 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  32.04 
 
 		 536 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 		 510 aa  209  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  41.9 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  41.9 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 433 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 433 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 433 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 		 433 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  41.5 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  41.5 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  42.86 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  42.86 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.25 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 		 306 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 302 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  43.02 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 		 426 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3326  maltose transporter membrane protein  32.6 
 
 		 512 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  42.64 
 
 		 317 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 		 451 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 321 aa  177  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  35.87 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 		 569 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 		 569 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 		 672 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 		 676 aa  155  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 		 309 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.55 
 
 		 317 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  34.29 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 		 305 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 321 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 		 312 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1880  fructose-bisphosphate aldolase  34.3 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  35.02 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>