More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3131 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  100 
 
 
520 aa  1032    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  54.67 
 
 
525 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  53.62 
 
 
515 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  55.25 
 
 
524 aa  528  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  53.48 
 
 
525 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  53.48 
 
 
525 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  53.48 
 
 
525 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  52.05 
 
 
524 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  54.6 
 
 
514 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  53.69 
 
 
514 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.686373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  53.69 
 
 
514 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  53.69 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  53.69 
 
 
514 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  53.49 
 
 
514 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  53.29 
 
 
514 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.97 
 
 
622 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
587 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  36.9 
 
 
535 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
575 aa  283  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  34.57 
 
 
534 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
568 aa  280  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  36.56 
 
 
525 aa  277  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
505 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
577 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
577 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
577 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  34.96 
 
 
541 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
584 aa  263  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.39 
 
 
546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
557 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
531 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  35.03 
 
 
518 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  34.81 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  35.92 
 
 
544 aa  237  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  35.19 
 
 
506 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
510 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
535 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  33.92 
 
 
546 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  34.1 
 
 
536 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12280  permease component of ABC-type sugar transporter  32.76 
 
 
525 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.03304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  42.91 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  40.32 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  40.32 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
433 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  39.92 
 
 
433 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  39.92 
 
 
433 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  39.92 
 
 
435 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
435 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3326  maltose transporter membrane protein  33.4 
 
 
512 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  39.92 
 
 
435 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
435 aa  186  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
426 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
426 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
422 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
422 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
306 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
447 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  43.19 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
302 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.59 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
321 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
317 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  40.86 
 
 
470 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
676 aa  168  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
672 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
474 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
450 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
312 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
569 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  34.34 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
569 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
442 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
569 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
309 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.71 
 
 
317 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  35.61 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
321 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
305 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  35.2 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2134  maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein MalF  37.07 
 
 
429 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
337 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>