More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3078 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 546 aa  1081    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.38 
 
 		 546 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  60.88 
 
 		 534 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  56.61 
 
 		 541 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  53.64 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  53.16 
 
 		 535 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.11 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  50.1 
 
 		 544 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  54.6 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  48.17 
 
 		 506 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 531 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  40.15 
 
 		 525 aa  363  4e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  42.94 
 
 		 518 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  40.87 
 
 		 536 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3326  maltose transporter membrane protein  37.98 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12280  permease component of ABC-type sugar transporter  37.64 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.03304  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  33.08 
 
 		 524 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  33.65 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  32.95 
 
 		 515 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  34.53 
 
 		 514 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  33.13 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.686373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  34.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  34.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  34.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  34.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  34.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  34.33 
 
 		 514 aa  257  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  33.4 
 
 		 525 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  34.33 
 
 		 514 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 		 577 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 		 568 aa  250  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  33.47 
 
 		 514 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  33.47 
 
 		 514 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  33.47 
 
 		 514 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  33.47 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  33.27 
 
 		 514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  31.08 
 
 		 525 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  31.08 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  31.08 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  34.66 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 		 575 aa  223  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 		 622 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  39.69 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  40.54 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  40.54 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  40.15 
 
 		 433 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  40.15 
 
 		 433 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 		 433 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 		 321 aa  189  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 		 302 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 		 306 aa  181  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 317 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  41.6 
 
 		 317 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 		 435 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  37.45 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  37.45 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  36.27 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 434 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  39.76 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1442  maltose ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00962141  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 		 672 aa  155  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  35.87 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0220  ABC-type sugar transport system, permease component  32.37 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000665755  hitchhiker  0.00000000142762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 		 676 aa  143  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1880  fructose-bisphosphate aldolase  35.97 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 		 569 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 569 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2134  maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein MalF  35 
 
 		 429 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 		 304 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 		 321 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 		 345 aa  123  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>