More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2134 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2134  maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein MalF  100 
 
 
429 aa  867    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.06 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  39.72 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
442 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  37.95 
 
 
470 aa  293  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1442  maltose ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 
456 aa  289  7e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00962141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
426 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
435 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
433 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
433 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
433 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
433 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
433 aa  278  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  37.56 
 
 
433 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  37.56 
 
 
433 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 
433 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
436 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  37.32 
 
 
433 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  37.32 
 
 
433 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
434 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  36.04 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  36.04 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  36.16 
 
 
464 aa  253  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
422 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
422 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1880  fructose-bisphosphate aldolase  35.35 
 
 
462 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  34.26 
 
 
452 aa  227  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0220  ABC-type sugar transport system, permease component  33.41 
 
 
451 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000665755  hitchhiker  0.00000000142762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
468 aa  222  9e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
676 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
321 aa  199  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
672 aa  186  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
306 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
584 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
546 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
575 aa  170  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  36.86 
 
 
534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
577 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
302 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  39.3 
 
 
506 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
577 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
531 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
577 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  35.42 
 
 
524 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
587 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
577 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  36.11 
 
 
524 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
505 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
312 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
557 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 
534 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  36.33 
 
 
535 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.31 
 
 
317 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  34.63 
 
 
541 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  37.5 
 
 
544 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  35 
 
 
546 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  34.23 
 
 
515 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  32.81 
 
 
525 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  34.5 
 
 
514 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  34.5 
 
 
514 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  34.5 
 
 
514 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  34.5 
 
 
514 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  34.5 
 
 
514 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  36.05 
 
 
541 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  34.5 
 
 
514 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  34.5 
 
 
514 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  34.5 
 
 
514 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
569 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  32.42 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  32.42 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  32.42 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.64 
 
 
569 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  32.56 
 
 
514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.686373 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
568 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  34.11 
 
 
514 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  34.11 
 
 
514 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  34.11 
 
 
514 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  34.11 
 
 
514 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  31.54 
 
 
525 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  34.11 
 
 
514 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3326  maltose transporter membrane protein  37.01 
 
 
512 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  36.19 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
450 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  34.9 
 
 
536 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
622 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.53 
 
 
295 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.798667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
451 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
474 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
338 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
535 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  33.99 
 
 
518 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>