More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2959 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  80.05 
 
 		 435 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 434 aa  874    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.31 
 
 		 434 aa  846    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.22 
 
 		 435 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.05 
 
 		 435 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  80.05 
 
 		 435 aa  701    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  67.06 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.2 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  65.8 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  65.8 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  65.8 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  65.8 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.8 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  65.87 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  65.8 
 
 		 433 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  65.56 
 
 		 433 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  65.56 
 
 		 433 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.72 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 		 442 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 		 676 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 		 672 aa  272  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  35.44 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  37.47 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2134  maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein MalF  36.11 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1442  maltose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00962141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  34.72 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 		 584 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 575 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 		 577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 		 577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 		 577 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 		 306 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  33.18 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1880  fructose-bisphosphate aldolase  35.05 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 		 309 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  41.67 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  40.86 
 
 		 534 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 		 321 aa  199  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 		 569 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 		 569 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  38.74 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 		 569 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  38.74 
 
 		 515 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 587 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  38.13 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  38.37 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  38.34 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  38.34 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  38.34 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  40.87 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  40.87 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  40.87 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  40.87 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  39.13 
 
 		 514 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.686373 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 568 aa  192  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  40.48 
 
 		 514 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 		 505 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0220  ABC-type sugar transport system, permease component  32.55 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000665755  hitchhiker  0.00000000142762 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  35.27 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  40.08 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  34.24 
 
 		 525 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  40.81 
 
 		 520 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  38.52 
 
 		 544 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  41 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 		 622 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 		 450 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  35.77 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  35.52 
 
 		 546 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.94 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.44963 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 		 292 aa  156  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  36.82 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12280  permease component of ABC-type sugar transporter  37.5 
 
 		 525 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.03304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 337 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 		 305 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  34.88 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>