More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12280  permease component of ABC-type sugar transporter  100 
 
 
525 aa  1050    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.03304  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03800  permease component of ABC-type sugar transporter  47.44 
 
 
525 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.279765  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.68 
 
 
510 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0831  multiple sugar transport system permease protein  46.01 
 
 
536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5855  Fructose-bisphosphate aldolase  43.32 
 
 
518 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333892  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1526  Fructose-bisphosphate aldolase  44.61 
 
 
534 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24006  normal  0.935201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
535 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
557 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2161  Fructose-bisphosphate aldolase  44.8 
 
 
541 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
546 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13870  permease component of ABC-type sugar transporter  40.11 
 
 
535 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3326  maltose transporter membrane protein  42.91 
 
 
512 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203761 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
531 aa  332  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1782  Fructose-bisphosphate aldolase  41.59 
 
 
534 aa  329  9e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22440  permease component of ABC-type sugar transporter  41.13 
 
 
544 aa  321  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0833814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0941  maltose transporter membrane protein  40.23 
 
 
506 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3078  Fructose-bisphosphate aldolase  37.64 
 
 
546 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
584 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.111059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
575 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.762963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4473  maltose transporter membrane protein  33.95 
 
 
525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1484  Fructose-bisphosphate aldolase  41.99 
 
 
541 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.497856  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0237  maltose transporter membrane protein  35.7 
 
 
514 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.686373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4622  maltose transporter membrane protein  35.98 
 
 
514 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116999 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001329  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalF  35.02 
 
 
515 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.848385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
577 aa  272  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
577 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.441279  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4485  maltose transporter membrane protein  36.51 
 
 
514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0464786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4570  maltose transporter membrane protein  36.31 
 
 
514 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.880617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
577 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4571  maltose transporter membrane protein  36.22 
 
 
514 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0143691 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05215  maltose transporter membrane protein  34.46 
 
 
524 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4420  maltose transporter membrane protein  35.9 
 
 
514 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307246 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0295  maltose transporter membrane protein  35.17 
 
 
524 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.334179  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03905  maltose transporter subunit  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3963  Fructose-bisphosphate aldolase  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4495  maltose transporter membrane protein  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654176  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3996  maltose transporter membrane protein  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0600719  normal  0.596443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4584  maltose transporter membrane protein  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4273  maltose transporter membrane protein  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5514  maltose transporter membrane protein  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.957845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03865  hypothetical protein  34.49 
 
 
514 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3915  maltose transporter membrane protein  33 
 
 
525 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.684328  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0305  maltose transporter membrane protein  33 
 
 
525 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0377  maltose transporter membrane protein  33 
 
 
525 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
568 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0222673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.66 
 
 
587 aa  252  9.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000276782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
505 aa  249  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3131  maltose transporter membrane protein  33.54 
 
 
520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0994344  decreased coverage  0.00445018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
474 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
622 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00161324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
422 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
422 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
436 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
433 aa  193  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00611933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4063  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
433 aa  193  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3753  maltosaccharide ABC transporter, permease  40.16 
 
 
433 aa  193  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3769  maltosaccharide ABC transporter, permease  40.16 
 
 
433 aa  193  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4031  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
433 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4137  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
433 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.355627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1121  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 
433 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00971383  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4118  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.16 
 
 
433 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
321 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3921  maltosaccharide ABC transporter permease  39.76 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4228  maltosaccharide ABC transporter permease protein  39.76 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
434 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
433 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.301051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
435 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00078522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
451 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202514  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3884  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  37.8 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
306 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0915  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  37.8 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.251124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
447 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
450 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642628  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2153  Fructose-bisphosphate aldolase  37.07 
 
 
451 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216937  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2337  maltose ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
317 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
309 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.156586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
676 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04130  permease component of ABC-type sugar transporter  38.85 
 
 
470 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.346323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
302 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000715095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2651  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 
317 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.61 
 
 
569 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
569 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
569 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
672 aa  159  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1442  maltose ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00962141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
312 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1854  ABC-type sugar transport system, permease component  35.14 
 
 
452 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.633345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0220  ABC-type sugar transport system, permease component  31.71 
 
 
451 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000665755  hitchhiker  0.00000000142762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
442 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00309195  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1296  ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
468 aa  143  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.62 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2134  maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein MalF  38.14 
 
 
429 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
305 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2346  fructose-bisphosphate aldolase  33.59 
 
 
464 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
321 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>