More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16700 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
259 aa  500  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  40.54 
 
 
257 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  38.19 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  39.84 
 
 
253 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  34.52 
 
 
264 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  33.85 
 
 
261 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  36.29 
 
 
260 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 
261 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 
264 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 
260 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
255 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 
265 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  32.79 
 
 
261 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  35.89 
 
 
257 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  34.14 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  31.87 
 
 
264 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  31.97 
 
 
261 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  34.2 
 
 
254 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  35.71 
 
 
255 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  35.71 
 
 
255 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  35.71 
 
 
255 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  32.94 
 
 
253 aa  141  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  31.47 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  35.34 
 
 
267 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  32.64 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  32.22 
 
 
264 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  36.91 
 
 
254 aa  135  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 
259 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.8 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  31.43 
 
 
261 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  31.4 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  35.24 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  30.5 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  34.4 
 
 
261 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  36.11 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.76 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  30.36 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  31.97 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 
261 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  32.26 
 
 
258 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  34.03 
 
 
256 aa  125  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  30.2 
 
 
253 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  31.51 
 
 
264 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 
264 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  33.65 
 
 
247 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 
264 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 
264 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 
264 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  31.12 
 
 
264 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
260 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  35.12 
 
 
260 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
260 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.43 
 
 
260 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  33.9 
 
 
260 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  30.88 
 
 
263 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  34.16 
 
 
258 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  32.82 
 
 
262 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  32.19 
 
 
256 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.39 
 
 
263 aa  122  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  35.75 
 
 
236 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  34.88 
 
 
253 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.32 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  34.93 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  30.77 
 
 
259 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  35 
 
 
253 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.22 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  30.49 
 
 
261 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  30.49 
 
 
258 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1408  type III secretion system inner membrane R protein  31.3 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  34.45 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  34.75 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  35.17 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  30.86 
 
 
258 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  31.5 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  31.51 
 
 
260 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  34.75 
 
 
260 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  33.02 
 
 
260 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  31.69 
 
 
264 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  30.86 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  32.31 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  37.56 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 
261 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>