224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6155 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6155  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  833    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2027  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 430 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  25.15 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  27.61 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.74 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  24.56 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  24.38 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  24.36 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  24.65 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.57 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  24.78 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  24.51 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  24.78 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  24.78 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  21.11 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.93 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  24.78 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.38 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.21 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.38 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  26.25 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  22 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.14 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.22 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.22 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.48 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.33 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  24.71 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  24.01 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.17 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.49 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  22.99 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  28.29 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  28.78 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  28.78 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.56 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.5 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  22.11 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  28.78 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.96 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  28.78 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.96 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  21.99 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>