46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5454 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  100 
 
 		 356 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  35.57 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  35.85 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  33.24 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  34.21 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  33.52 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  31.55 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  32.02 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  30.92 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  30.54 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  30.77 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  27.89 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  34.85 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  23.03 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  21.9 
 
 		 497 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  20.72 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.39 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  32.39 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1047 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  38.1 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1348 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  50 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  32.89 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  33.33 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  40.91 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  39.53 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  41.3 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  22.8 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3745  cell division ATP-binding protein FtsE  40.43 
 
 		 224 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  31.75 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  36.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  31.75 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  35.53 
 
 		 564 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  36.36 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1277 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 572 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>