74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4870 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  100 
 
 
293 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4778  Allergen V5/Tpx-1 related  39.25 
 
 
233 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.435965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4777  Allergen V5/Tpx-1 related  41.08 
 
 
214 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.497987  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2270  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.26 
 
 
208 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1168  hypothetical protein  43.58 
 
 
217 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.452749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0824  putative lipoprotein  40.88 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000106095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5182  SCP-like extracellular  40.84 
 
 
309 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0292  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.37 
 
 
208 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3057  SCP-like extracellular  39.15 
 
 
205 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0796  Allergen V5/Tpx-1 related protein  40.98 
 
 
212 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1216  SCP-like extracellular  38.1 
 
 
205 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.56 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1620  Allergen V5/Tpx-1 related  43.68 
 
 
217 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1475  SCP-like extracellular  35.63 
 
 
192 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0179083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  35.78 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
205 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  28.7 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  28.7 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  35.48 
 
 
197 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  29.84 
 
 
541 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  32 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  32.14 
 
 
222 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  31.3 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  31.48 
 
 
283 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  37.5 
 
 
410 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  27.78 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  32.43 
 
 
500 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  30.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  30.51 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  29.66 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  30.43 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  26.32 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.68 
 
 
203 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.53 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.16 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  27.21 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  27.78 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  32.08 
 
 
450 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.19 
 
 
212 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  27.83 
 
 
328 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  30.77 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  27.42 
 
 
196 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  30.85 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  27.59 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.21 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3270  allergen V5/TPX-1 family protein  24.75 
 
 
228 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  30.97 
 
 
206 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.72 
 
 
444 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.63 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  34.04 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  31.52 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  28.72 
 
 
465 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  24.8 
 
 
200 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  34.78 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  28.42 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  26.55 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  30.85 
 
 
287 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  27.83 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  30.95 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  36.49 
 
 
176 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  32.22 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.97 
 
 
129 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  27.55 
 
 
167 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  29.35 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 
188 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  30.11 
 
 
162 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.63 
 
 
178 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>