More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1713 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  46.8 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  42.92 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4339  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.975502  normal  0.0924805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  45.51 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  46.86 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4234  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0154099  normal  0.59978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 		 243 aa  85.5  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.45 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  44.59 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.48 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  39.39 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  37.72 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  33.13 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  45.37 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  37.93 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  45.22 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  36.57 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  35.81 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  35.98 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  32.92 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  32.08 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  43.1 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  36.25 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  36.81 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  31.77 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.71 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.71 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  36.2 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  40.74 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.71 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  35.03 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  35.03 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  31.9 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  31.9 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.71 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>