75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1689 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  72.77 
 
 		 241 aa  337  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.88 
 
 		 229 aa  331  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.98 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3439  hypothetical protein  71.07 
 
 		 202 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.62 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.6 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  24.35 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  29.21 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  21.97 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  25.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  22.77 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  21.88 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  27.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  27.75 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  21.88 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  21.88 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  27.93 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  21.88 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.69 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25.88 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  21.72 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.88 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  32.58 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 854 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.29 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.29 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  25.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  34.72 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  26.67 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  25.29 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  26.79 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25.79 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  28.16 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  34.72 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  31.08 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  29.69 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 347 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  27.36 
 
 		 232 aa  45.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  29.67 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  36.11 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  33.33 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  25.56 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  31.08 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  45 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  27.91 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  28.88 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  31.08 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 327 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  31.18 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 530 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.09 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 		 232 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  27.78 
 
 		 347 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  36.21 
 
 		 321 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  33.68 
 
 		 213 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>