More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1647 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1647  Patatin  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4233  patatin  62.28 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.22 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.22 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.59 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  39.16 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  38.16 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.59 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.59 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.59 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  37.32 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.59 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.59 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.63 
 
 		 310 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.59 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.96 
 
 		 263 aa  88.2  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  38.46 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.06 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.14 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.25 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  32.97 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.36 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.25 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.41 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  34.75 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  34.04 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  34.04 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  34.04 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  34.04 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.72 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  35.66 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  34.04 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.66 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.66 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.66 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  35.66 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  35.54 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  35.81 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.25 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  35.4 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.67 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.08 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  33.33 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  37.14 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  34.75 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  34.75 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  32 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  33.55 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.37 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  35.44 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.97 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  34.44 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.44 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  29.58 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.78 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  32.7 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  36.17 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  36.43 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  33.1 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  35.66 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  34.38 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  33.33 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  34.56 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  36.88 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  33.33 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.88 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  35.66 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.55 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  31.06 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.91 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  35.03 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  34.97 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  34.03 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  34.57 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.25 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  34.32 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.18 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.65 
 
 		 330 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  34.71 
 
 		 322 aa  72  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  32.32 
 
 		 314 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  36.81 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.73 
 
 		 728 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  34.57 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  30.94 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4027  patatin  32.03 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.353324  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  35.21 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.17 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.56 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  34.62 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  31.12 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  31.43 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.68 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  30.82 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.56 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.85 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.48 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  37.01 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>