More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1988 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 401 aa  804    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.11 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.33 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.06 
 
 		 386 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.23 
 
 		 389 aa  408  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.55 
 
 		 386 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.42 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.32 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  51.56 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.4 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.26 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.26 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.26 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.51 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.69 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.91 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.48 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  52.06 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.55 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.55 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.7 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.23 
 
 		 386 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  51.29 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.44 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.83 
 
 		 387 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.44 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  51.55 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  54.23 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  49.23 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.22 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.23 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  50.77 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  49.87 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.52 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.37 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  51.03 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  50.77 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.29 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.44 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.25 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.82 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3098  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.56 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 		 382 aa  378  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.34 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.56 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.86 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.91 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  49.49 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.82 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.57 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.56 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.57 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2513  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.44 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.955755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.04 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  49.22 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0805  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.81 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.623629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  49.87 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.04 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2506  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.44 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.44 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.64 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.91 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>