56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1709 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1709  DinB family protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  42.5 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  41.92 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  39.66 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  42.65 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  39.66 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  40.56 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  35.48 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  35.75 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  38.67 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  36.05 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  36.77 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  39.88 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  36.25 
 
 		 170 aa  94  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  36.25 
 
 		 170 aa  94  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  40 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  37.11 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  38.1 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  32.93 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  32.89 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  32.68 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  29.83 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  31.79 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  32.28 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  31.79 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  32.39 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  34.39 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  34.67 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  31.47 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  32.9 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  30.67 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  30.46 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  32.1 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  31.47 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  31.71 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  29.93 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  31.48 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  26.17 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  25.33 
 
 		 277 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  22.22 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  23.49 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0663  DinB family protein  26.92 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0794  DinB family protein  24.84 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  25.34 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  21.48 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1538  DinB family protein  26.15 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000310832  normal  0.100451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6208  DinB family protein  30.48 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  25.47 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3027  hypothetical protein  40.35 
 
 		 87 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0464615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  24.71 
 
 		 173 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  23.23 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  24.02 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  23.9 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  24.53 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>