211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3175 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3175  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
400 aa  799    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142752  normal  0.23342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  41.61 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  39.62 
 
 
389 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  33.13 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  32.81 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  34.86 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  32.39 
 
 
356 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  28.96 
 
 
351 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  31.66 
 
 
346 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  31.85 
 
 
347 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  31.78 
 
 
358 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  29.55 
 
 
368 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  26.5 
 
 
356 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  29.94 
 
 
346 aa  149  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  28.03 
 
 
356 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  32.28 
 
 
340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  29.79 
 
 
363 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  29.3 
 
 
356 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.29 
 
 
334 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  32.19 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  30.12 
 
 
363 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  29.33 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  32.02 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  29.01 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  30.79 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  32.39 
 
 
334 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  29.28 
 
 
368 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  31.43 
 
 
330 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  31.3 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  29.86 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  29.2 
 
 
354 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  30.09 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 
354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  26.72 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  28.36 
 
 
347 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  27.59 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  27.59 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  27.59 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  27.59 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  27.59 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  27.59 
 
 
355 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 
338 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  30.09 
 
 
330 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  28.9 
 
 
359 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  28.9 
 
 
359 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  29.51 
 
 
407 aa  126  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  27.3 
 
 
355 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  28.74 
 
 
366 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  28.21 
 
 
340 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  28.8 
 
 
334 aa  123  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  30.16 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  26.99 
 
 
358 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  29 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  27.93 
 
 
413 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  27.94 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  29.57 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  28 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  27.53 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  26.88 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  31.63 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  27.49 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.16 
 
 
331 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  28.16 
 
 
331 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  28.73 
 
 
403 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  29.7 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  28.16 
 
 
330 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  26.97 
 
 
358 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.44 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  31.47 
 
 
331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  27.62 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  28.45 
 
 
356 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  27.64 
 
 
377 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  26.64 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  27.55 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  28.03 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  29.73 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1075  basic membrane lipoprotein  28.42 
 
 
404 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00227041  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  27.99 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  25 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  27.22 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  27.04 
 
 
365 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  30.31 
 
 
380 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  27.22 
 
 
339 aa  107  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  28.19 
 
 
356 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 
339 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  28.83 
 
 
368 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 
328 aa  106  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  26.05 
 
 
371 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  26.71 
 
 
386 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  26.06 
 
 
341 aa  104  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  27.4 
 
 
366 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  27.32 
 
 
364 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  26.65 
 
 
351 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  25.69 
 
 
370 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  26.89 
 
 
331 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  25.23 
 
 
368 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>