180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1576 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1576  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 423 aa  882    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1575  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2193  Radical SAM domain protein  41.1 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00124948 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5485  Radical SAM domain protein  46.64 
 
 		 316 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.269586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 258 aa  92.8  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 256 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  30.27 
 
 		 182 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 298 aa  87  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  30.5 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  29.25 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  31 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  29.69 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  30 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  30.5 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  26.1 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  29.5 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 258 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  29 
 
 		 377 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  30.57 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  28 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  27.18 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  28.36 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  26.13 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.1 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  28 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  26.11 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  28 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  28.22 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  26.11 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  26.94 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  25.89 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  28.86 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  26.81 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  26.37 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  27.8 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1488  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000243834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1107  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.614864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 302 aa  67  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 352 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 386 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0055  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>