122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1984 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1984  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  873    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.179831 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  63.28 
 
 		 427 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  58.45 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2341  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.74 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 392 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 395 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 396 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 386 aa  53.5  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.75 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  25.21 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  37.89 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  22.92 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 395 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.69 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 439 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.41 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  21.05 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  21.05 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  20.19 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 408 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  29.41 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  27 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.38 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  28.24 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  20.05 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  35.96 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.01 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  20.55 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  27.31 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  28.24 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  25.11 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  20.55 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  26.52 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0498  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000266788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  27.06 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  31.71 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>