More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0606 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  100 
 
 
380 aa  754    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  79.73 
 
 
376 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  81.66 
 
 
399 aa  559  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  81.87 
 
 
392 aa  559  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  81.08 
 
 
409 aa  536  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  77.21 
 
 
381 aa  535  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  79.44 
 
 
386 aa  530  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  73.17 
 
 
384 aa  522  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  44.34 
 
 
361 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.52 
 
 
345 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  42.33 
 
 
361 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  41.58 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  42.65 
 
 
363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  39.29 
 
 
307 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  39.79 
 
 
289 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  40.54 
 
 
290 aa  216  8e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  41.79 
 
 
304 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  41.16 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  40.48 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.92 
 
 
285 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  39.1 
 
 
305 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  40.36 
 
 
268 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  38.75 
 
 
305 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  40.36 
 
 
268 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.36 
 
 
268 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  41.13 
 
 
268 aa  209  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  39.72 
 
 
356 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  36.15 
 
 
322 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  37.28 
 
 
309 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.86 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  37.32 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  37.87 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  39.86 
 
 
304 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  35.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  38.81 
 
 
305 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  34.12 
 
 
322 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.35 
 
 
322 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.35 
 
 
321 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  35.35 
 
 
322 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  35.35 
 
 
322 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  35.35 
 
 
322 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  35.35 
 
 
321 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.35 
 
 
321 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  35.51 
 
 
456 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  38.43 
 
 
305 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  38.43 
 
 
305 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  34.68 
 
 
322 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  38.08 
 
 
305 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  38.08 
 
 
305 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  38.08 
 
 
305 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  39.02 
 
 
306 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  38.08 
 
 
305 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  38.08 
 
 
305 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.08 
 
 
305 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  36.68 
 
 
304 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.08 
 
 
304 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  36.77 
 
 
394 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  38.68 
 
 
403 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.46 
 
 
312 aa  192  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0307  band 7 protein  38.61 
 
 
285 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  36.63 
 
 
369 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  36.39 
 
 
369 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  41.5 
 
 
361 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  35.99 
 
 
304 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.85 
 
 
314 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  40.82 
 
 
439 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  37.8 
 
 
301 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  41.3 
 
 
321 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  41.3 
 
 
321 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  36.03 
 
 
311 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  36.43 
 
 
304 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  36.43 
 
 
304 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  36.43 
 
 
304 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  40.47 
 
 
307 aa  186  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.62 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  36.86 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  34.07 
 
 
326 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.39 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  36.71 
 
 
429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  34.46 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.52 
 
 
306 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  38.66 
 
 
396 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  41.05 
 
 
317 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  33.22 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.4 
 
 
311 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  37.5 
 
 
398 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  35.56 
 
 
327 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  36.71 
 
 
308 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.81 
 
 
311 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.4 
 
 
318 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  43.63 
 
 
304 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.47 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  37.59 
 
 
402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.45 
 
 
314 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>