61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3569 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  100 
 
 		 430 aa  863    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  44.41 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  34.9 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  29.89 
 
 		 359 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  33.9 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  33.12 
 
 		 350 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  31.14 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  28.27 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.68 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  31.4 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  25.65 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  25.16 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  29.01 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  33.09 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  31.51 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  30.99 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  29.61 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  30.61 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  29.13 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  29.53 
 
 		 344 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  31.06 
 
 		 343 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  24.68 
 
 		 317 aa  53.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  24.89 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  27.1 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  30.08 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  26.43 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  25 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.79 
 
 		 242 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  23.38 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  31.91 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  28.12 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  23.91 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  28.36 
 
 		 329 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  26.39 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  24.65 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  23.56 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  26.01 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  24.56 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10175  predicted protein  24.38 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.101651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  30.85 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  31.2 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  26.01 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  25.73 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  25.73 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  29.52 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  30 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  29.22 
 
 		 191 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  31.63 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  23.98 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.69 
 
 		 706 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  28.57 
 
 		 430 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  30.19 
 
 		 376 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  25.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  25.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5243  precorrin-6B methylase  27.82 
 
 		 200 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  23.85 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>