More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1541 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1541  ABC transporter related  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1569  ABC transporter related  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  39.44 
 
 
530 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  36.8 
 
 
525 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 
540 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  38.46 
 
 
552 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.36 
 
 
525 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.41 
 
 
568 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  38.85 
 
 
552 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.39 
 
 
322 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  38.49 
 
 
541 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  38.91 
 
 
541 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  38.25 
 
 
548 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.55 
 
 
534 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  40.25 
 
 
539 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 
346 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  36.4 
 
 
527 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  39.08 
 
 
534 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.82 
 
 
340 aa  158  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  37.89 
 
 
533 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
572 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  40.16 
 
 
547 aa  157  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.77 
 
 
612 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  37.89 
 
 
542 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  36.25 
 
 
562 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  36.61 
 
 
542 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  35.77 
 
 
612 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
347 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4731  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
329 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
623 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
623 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
623 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 
329 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  34.11 
 
 
532 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  36.61 
 
 
542 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
623 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3018  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
335 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.56 
 
 
536 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
629 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08350  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  34.68 
 
 
673 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 
536 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  37.25 
 
 
545 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.65 
 
 
578 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 
353 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  35.29 
 
 
537 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0817  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 
326 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
347 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0422  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0437  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  36.08 
 
 
536 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  36.86 
 
 
537 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  35.22 
 
 
619 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  36.61 
 
 
571 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5040  ABC transporter related  37.07 
 
 
557 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 
333 aa  154  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
328 aa  154  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  35.94 
 
 
603 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  36.43 
 
 
327 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  39.06 
 
 
553 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  36.4 
 
 
537 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  33.59 
 
 
571 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
563 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2851  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.05 
 
 
341 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.73 
 
 
547 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
623 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  35.57 
 
 
545 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  35.19 
 
 
586 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  35.97 
 
 
524 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  37.15 
 
 
543 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.33 
 
 
350 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  36.61 
 
 
542 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
554 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.22 
 
 
392 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.05 
 
 
230 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205731  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.85 
 
 
619 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.31 
 
 
575 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  35.43 
 
 
547 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
623 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 
557 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 
546 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3919  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
337 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  37.15 
 
 
543 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0426  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.69 
 
 
321 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
328 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.76985  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  36.86 
 
 
557 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 
347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  35.14 
 
 
564 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  37.7 
 
 
556 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  36.82 
 
 
545 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  36.51 
 
 
539 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  34.92 
 
 
536 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1951  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.5 
 
 
322 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>