294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1262 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1262  Thioredoxin domain  100 
 
 
128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000573175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  31.82 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  27.27 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  25.26 
 
 
268 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1040  Thioredoxin domain protein  30.43 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  27.5 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  27.71 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.43 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  25.61 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  26.26 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  28.24 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3093  hypothetical protein  24.71 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113283  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  27.59 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  29.73 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0162  thioredoxin domain protein  20.16 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  29.73 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  31.51 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  27.27 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  30.26 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  29.73 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  34.25 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  25.47 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  30.39 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  28.75 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  29.73 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 
244 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.26 
 
 
302 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.17 
 
 
302 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  27.38 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  25.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  35.29 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  25.88 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  32.94 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  31.94 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  25.88 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  28.77 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  25.96 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  22.77 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  28.77 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  28.77 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  29.13 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  31.18 
 
 
153 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  32.99 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  27.63 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  24.39 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  27 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  27.27 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  29.27 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  32.56 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  27.47 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  27.27 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  25.69 
 
 
460 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  25.3 
 
 
285 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  27.63 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  27.63 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  25.32 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  30.26 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  29.33 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.14 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1471  thioredoxin  30.19 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000657673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  28.77 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  25 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  30.26 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  30.26 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  25.84 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  30.56 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  29.2 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  28.77 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  27.45 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0161  hypothetical protein  27.91 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.130798  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  27.45 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0179  hypothetical protein  31.34 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  25.47 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0180  hypothetical protein  31.34 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000228172  hitchhiker  3.99309e-36 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  27.47 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  20.73 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  29.49 
 
 
357 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2606  putative thioredoxin-like protein  21.35 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.888104  normal  0.656305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  31.43 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  20.73 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  30.59 
 
 
223 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  25 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  27.47 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  27.45 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  25.51 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  28.05 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  28.89 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  29.49 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  27.91 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  28.36 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  30 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  31.08 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>