142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0458 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0458  prepilin peptidase  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  35.38 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  36.15 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  36.15 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  36.15 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  35.38 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  29.23 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  27.52 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  28.46 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  30.99 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  29.69 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  23.86 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  29.69 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  26.28 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  32.67 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.89 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  32 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.15 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  28.68 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  34.44 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  31.78 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  23.75 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  29.8 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  28.57 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  34.44 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  28.79 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  26.81 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  29.85 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  29.17 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  33.33 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.846368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  29.85 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.16 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  32.04 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3809  type III leader peptidase  35.71 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00060894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3638  type III leader peptidase  35.71 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3746  type III leader peptidase  35.71 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00764822  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  24.24 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  33.67 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  31.63 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0364  leader peptidase TcpJ  27.07 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.692702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  27.91 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3638  leader peptidase HopD  33.96 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000886735  normal  0.214059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3711  leader peptidase HopD  35.71 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00474586  normal  0.728501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  26.24 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  29.08 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  31.07 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  30.37 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  30.39 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.56 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  28.57 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.68 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  32.37 
 
 		 155 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  26.67 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  27.01 
 
 		 166 aa  52  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.63 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  26.12 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.91 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.41 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  33.63 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  32.99 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  31.11 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  27.21 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.11 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  22.7 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  29.55 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.46 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.01 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  29.03 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  29.03 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  29.03 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  29.03 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  25.78 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  30.93 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  27.66 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  27.96 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  27.66 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  27.66 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.93 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  27.66 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  27.66 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.735955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  27.82 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  38.37 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.82 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.71 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  29.79 
 
 		 308 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.55 
 
 		 308 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  29.79 
 
 		 308 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.72 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  27.48 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  27.69 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.69 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  31.96 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  27.82 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  27.82 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  27.82 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  23.88 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  23.88 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  28.72 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>