130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3797 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3797  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 343 aa  704    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2881  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  30.55 
 
 		 370 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275572 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1607  putative ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.47 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.86 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  23 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.71 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.04 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.47 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  25.39 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  23.23 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  23.9 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  24.26 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.39 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.69 
 
 		 779 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.49 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.9 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.34 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  22.53 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.66 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  20.47 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  22.12 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.12 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.27 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  20.62 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.84 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  20.19 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  20.81 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.55 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3383  glycosyl transferase family 9  22.41 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  21.92 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.3 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  37.5 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.74 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  24.01 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.74 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.37 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  24.6 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2764  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  41.82 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.32 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.32 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.32 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  21.15 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.3 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  23.25 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.63 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.76 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3061  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.87 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.85 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.63 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.63 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2963  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.87 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  26.38 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3028  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.87 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.63 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.3 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  23 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  32.35 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3100  glycosyl transferase family 9  26.62 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.649463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.38 
 
 		 781 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.62 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  22.55 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  19.38 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  25.49 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  25.49 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  22.26 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  20.88 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.29 
 
 		 353 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 354 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0678  glycosyl transferase family 9  33.63 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.46 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.1 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.49 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0069  glycosyl transferase family 9  22.92 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.960845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.4 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.33 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  21.04 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  21.56 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  22.82 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.54 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.19 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>