45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3493 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  276  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  35.16 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  35.16 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  39.71 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  38.17 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  36.07 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  34.51 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  33.05 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  34.13 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0315  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  35.59 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2996  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.190317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  32.2 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  30.51 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  29.7 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  38.24 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  30.77 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  29.66 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  29.03 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  28.8 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  32.33 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  27.12 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  29.7 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  28.93 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  25.42 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  29.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  25.37 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  29.75 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  28.45 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  28.93 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>