279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2896 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2896  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  100 
 
 
227 aa  440  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1590  acyl-CoA synthetase  59.01 
 
 
223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.502503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  39.34 
 
 
912 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  39.05 
 
 
689 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0708  CoA-binding domain-containing protein  42.6 
 
 
682 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  39.15 
 
 
707 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  40.64 
 
 
669 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  39.72 
 
 
698 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0318  acetyl-CoA synthetase (ADP forming), beta chain (AcdB)  40.1 
 
 
201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1910  CoA-binding domain protein  36.06 
 
 
676 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236564  normal  0.164304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  38.39 
 
 
698 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  33.64 
 
 
705 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.39 
 
 
696 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  38.28 
 
 
750 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  38.29 
 
 
728 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0109  hypothetical protein  37.04 
 
 
230 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  35.32 
 
 
711 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
706 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  41.04 
 
 
712 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  33.65 
 
 
707 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  38.98 
 
 
727 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.91 
 
 
715 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1805  hypothetical protein  38.21 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.657277  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  35.1 
 
 
688 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  36.06 
 
 
680 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  41.14 
 
 
699 aa  118  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
687 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  39.43 
 
 
704 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  41.48 
 
 
697 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  37.71 
 
 
701 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
918 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
710 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1991  CoA-binding domain protein  41.9 
 
 
711 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0485  hypothetical protein  34.06 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62536  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0454  CoA-binding domain protein  39.79 
 
 
690 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1855  ATP-grasp domain-containing protein  36.15 
 
 
232 aa  115  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  34.86 
 
 
921 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  33.18 
 
 
680 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.14 
 
 
929 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  36.15 
 
 
707 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  32.83 
 
 
698 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  39.77 
 
 
700 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  35.71 
 
 
920 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  36.41 
 
 
911 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  35.07 
 
 
711 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  38.42 
 
 
704 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  38.76 
 
 
715 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  34.76 
 
 
905 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  32.08 
 
 
687 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.19 
 
 
699 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  38.55 
 
 
727 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1092  hypothetical protein  33.18 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
694 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  36.74 
 
 
708 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  41.82 
 
 
697 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  36.52 
 
 
710 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0296  CoA-binding domain protein  40.94 
 
 
707 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000033493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  32.56 
 
 
703 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  35.51 
 
 
698 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  40.57 
 
 
719 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  32.86 
 
 
696 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1634  hypothetical protein  34.06 
 
 
229 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.155482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
893 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  35.68 
 
 
517 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  35.55 
 
 
718 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  37.2 
 
 
709 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  33.63 
 
 
711 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  36.9 
 
 
883 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  37.31 
 
 
710 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0137  ATP-grasp domain-containing protein  34.43 
 
 
253 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  35.47 
 
 
697 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
729 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
722 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  36.21 
 
 
722 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  41.81 
 
 
693 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.03 
 
 
892 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
890 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
896 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  39.87 
 
 
711 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  37.38 
 
 
712 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  35.75 
 
 
713 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
904 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  33.18 
 
 
918 aa  101  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  34.76 
 
 
915 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  35.22 
 
 
695 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
892 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  35.85 
 
 
715 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
901 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
908 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  37.23 
 
 
903 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  37.67 
 
 
687 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  36.87 
 
 
897 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
897 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  37.71 
 
 
903 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
926 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
889 aa  99  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  36.09 
 
 
911 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  34.42 
 
 
684 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  35.55 
 
 
705 aa  98.2  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  38.86 
 
 
887 aa  98.2  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>