More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1560 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 321 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1275  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000898965  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0747  rhodanese domain-containing protein  35.54 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1559  rhodanese domain-containing protein  30.59 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  30.98 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.78 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  31.94 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  31.8 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  32.5 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.03 
 
 		 271 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  29.48 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.85 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  28.14 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  26.93 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  30.6 
 
 		 291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  28.52 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0346  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  27.86 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  32.14 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.08 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  27.3 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.88 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.38 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  27.74 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.2 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  27.82 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  28.91 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  26.58 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  31.85 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  26.98 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  31.79 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  30.83 
 
 		 665 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  26.48 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  31.79 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  29.02 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  28.77 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 284 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  28.98 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.8 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  29.63 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  25.93 
 
 		 280 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  27.11 
 
 		 610 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  26.1 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  26.06 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  29.56 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  28.38 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.38 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.47 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.47 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  30.9 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  30.99 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  25.91 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  30.11 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  26.32 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  26.32 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 613 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  29.39 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  28.15 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.99 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  28.99 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  28.99 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.99 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  30.86 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.79 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  29.43 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  27.15 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.99 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.99 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.55 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0562  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  28.76 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1836  Rhodanese domain protein  27.68 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.62 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.5 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  27.87 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  29.1 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.62 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.62 
 
 		 281 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.31 
 
 		 276 aa  99.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  30.74 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.18 
 
 		 283 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>