More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0747 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0747  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.544739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 
321 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  33.57 
 
 
273 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 
272 aa  99.4  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.57 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 
296 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  30.23 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  29.17 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  32.77 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  34.66 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  30.05 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  29.01 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  32.8 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  33.69 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  29.55 
 
 
665 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  29.17 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  30.12 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  29.08 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.67 
 
 
613 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  29.05 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.63 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  29.32 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  28.79 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1275  Rhodanese domain protein  26.82 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000898965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.17 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  30.37 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  33.94 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  32.07 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.44 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.22 
 
 
610 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  28.06 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  30.3 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  30.13 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  29.33 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  30.3 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  28.24 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  29.69 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.58 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.8 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  28.91 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  28.38 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  29.83 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  30.49 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  28.94 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  28.68 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.16 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.95 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  35.47 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  29.26 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  29.05 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  29.18 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1774  rhodanese domain-containing protein  27.56 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.608218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  29.38 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.44 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.5 
 
 
627 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.81 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  28.37 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  31.91 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0587  rhodanese domain-containing protein  28.09 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287178  normal  0.0572789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  27.43 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.28 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  30.81 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  29.31 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  28.71 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  30.99 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  30.48 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  27.31 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.03 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.03 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  31.8 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.03 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  28.78 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  30.64 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.44 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  34.66 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  27.41 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  30.56 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.77 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  29.17 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.11 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>