More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1836 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1836  Rhodanese domain protein  100 
 
 
371 aa  760    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 
362 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  31.72 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
272 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.01 
 
 
288 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  32.75 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.12 
 
 
283 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  30.66 
 
 
281 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  29.34 
 
 
304 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  29.97 
 
 
281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 
306 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  31.67 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  31.52 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.64 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.64 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.64 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  28.87 
 
 
293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  28.87 
 
 
293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  29.33 
 
 
297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
282 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  30.6 
 
 
312 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
297 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  30.03 
 
 
304 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  29.11 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  32.25 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  32.25 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
282 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  30.45 
 
 
305 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  29.55 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.34 
 
 
282 aa  110  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 
301 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  28.98 
 
 
298 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  28.98 
 
 
298 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  28.98 
 
 
298 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  32.37 
 
 
277 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  31.65 
 
 
277 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 
281 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  31.64 
 
 
281 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.79 
 
 
297 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 
305 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  31.05 
 
 
279 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 
280 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  29.05 
 
 
296 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  31.35 
 
 
296 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  32.49 
 
 
287 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  31.05 
 
 
277 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  30.74 
 
 
297 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 
321 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
285 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  27.56 
 
 
284 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  29.49 
 
 
335 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 
297 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  30.8 
 
 
281 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  31.45 
 
 
286 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  29.15 
 
 
295 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  29.03 
 
 
273 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 
275 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 
275 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  27.82 
 
 
289 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  30.8 
 
 
279 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  33.09 
 
 
279 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
277 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.1 
 
 
284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  27.3 
 
 
285 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.1 
 
 
284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.1 
 
 
284 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
366 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  26.79 
 
 
285 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28.47 
 
 
293 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  29.86 
 
 
279 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  30.8 
 
 
279 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.5 
 
 
289 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
273 aa  99.8  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 
613 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  29.23 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  30.45 
 
 
290 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  29.24 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  26.52 
 
 
284 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  27.3 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  35.5 
 
 
305 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  26.46 
 
 
258 aa  97.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  28.83 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  29.1 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.72 
 
 
610 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  26.69 
 
 
270 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  27.38 
 
 
271 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  31.28 
 
 
271 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  27.87 
 
 
287 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  26.98 
 
 
294 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  29.14 
 
 
267 aa  93.6  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 
277 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  26.16 
 
 
284 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 
269 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  27.18 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>