More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0854 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  247  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  84.17 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  84.17 
 
 		 125 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  77.97 
 
 		 126 aa  193  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  75.81 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  75 
 
 		 120 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  74.58 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  59.35 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  46.9 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 240 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  37.29 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 235 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  37.29 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0626  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 460 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 		 446 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 243 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 243 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 		 515 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.29 
 
 		 239 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  36.8 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 385 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0791  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC (Ornithine/argininedecarboxylase inhibitor)  40.5 
 
 		 451 aa  70.9  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.261898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 244 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  70.1  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.22 
 
 		 464 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 496 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 240 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.69 
 
 		 223 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  33.88 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4173  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  37.93 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.89 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.89 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 		 492 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 473 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0328  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3884  winged helix family two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  38.79 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04881  two-component system regulatory protein  38.6 
 
 		 466 aa  67.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.476586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  35.48 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  42.68 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.82 
 
 		 502 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 483 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.19 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3630  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 502 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.670707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>