151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0405 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 286 aa  564  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  26.2 
 
 		 339 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  26.86 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  28.62 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  28.62 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  28.62 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  28.62 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  35.88 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  29.25 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  28.95 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  28.8 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  28.29 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  28.98 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  28.62 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.31 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  26.71 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  28.94 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  26.51 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  30.92 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  28.88 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.84 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  26.5 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  26.56 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  26.17 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  26.17 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  28.45 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  25.87 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  25.52 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  28.27 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  25.87 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  25.87 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  25.87 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  27.36 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  32.98 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  25.52 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  28.27 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  25.52 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  25.52 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  28.63 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  32.02 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  27.34 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  27.9 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  21.72 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  24.66 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  27.3 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26.91 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  28.96 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  25.37 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  25.44 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  26.1 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  26.07 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  28.8 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  34.09 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  34.59 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  34.59 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  29.66 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  32.93 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  26.85 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.5 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  27.62 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  24.13 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  26.3 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  29 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  25.82 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  31.36 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  28.64 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  24.74 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  26.88 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  25.45 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.05 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.04 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.2 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  26.25 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  25.68 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.27 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  23.49 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  29.67 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  26.73 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.13 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  23.95 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  25.28 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  30.46 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  26.05 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  24.86 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.09 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  28.19 
 
 		 381 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  24.44 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>