231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3431 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 417 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  35.58 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  34.46 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  30.69 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  32.31 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 408 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  31.62 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  31.1 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  31.41 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  31.17 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  31.02 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.11 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  31.02 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  30.52 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  30.52 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  31.11 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.87 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  29.51 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  29.87 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  29.51 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  30.29 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  28.87 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  28.87 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  28.87 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  28.87 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  29.87 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.51 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  29.51 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  29.51 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  29.61 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>