More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3118 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 460 aa  874    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.55 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  56.05 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.93 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  54.23 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  52.73 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.96 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  55.75 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.68 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.88 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.75 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.75 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  54.75 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  53.18 
 
 		 515 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.31 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.61 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  50.33 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  49.69 
 
 		 517 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  52.9 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.52 
 
 		 508 aa  346  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  51.96 
 
 		 489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  50.71 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  52.33 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  52.45 
 
 		 517 aa  338  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  51.05 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  54.58 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  52.27 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.18 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  52.68 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  50.5 
 
 		 543 aa  317  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  51 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  50.92 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.69 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  47.23 
 
 		 551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.12 
 
 		 502 aa  286  5e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.59 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  34.27 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36.04 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  38.36 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.29 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.62 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.22 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.85 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  34.66 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.72 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  33.99 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  35.57 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  35.98 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.94 
 
 		 455 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  35.38 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  36.54 
 
 		 457 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.5 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.1 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.15 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.62 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.79 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  29.48 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.42 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  29.66 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.79 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.28 
 
 		 447 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.62 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  39.73 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.11 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.11 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  31.3 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.92 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  37.69 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  29.72 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  29.3 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  25.27 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  35.97 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.32 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  29.18 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.18 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  39.66 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.3 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  30.71 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.32 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.32 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  40.49 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  35.04 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  39.44 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  29.37 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.35 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.15 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.04 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  29.15 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.53 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.58 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  31.2 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.4 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  31.96 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  31.3 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.17 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>