More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2151 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 
530 aa  1004    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  52.86 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  51.38 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  48.47 
 
 
526 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  39.61 
 
 
513 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  39.22 
 
 
513 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  39.41 
 
 
513 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  39.22 
 
 
513 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  39.41 
 
 
512 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  39.41 
 
 
513 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  39.41 
 
 
513 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  39.02 
 
 
513 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  39.22 
 
 
513 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  37.38 
 
 
506 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  39.24 
 
 
511 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  38.71 
 
 
512 aa  363  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  42.61 
 
 
519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  39.04 
 
 
511 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  39.04 
 
 
511 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  38.65 
 
 
511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  38.2 
 
 
518 aa  346  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  41.44 
 
 
530 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  39.92 
 
 
514 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  38.2 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  36.63 
 
 
517 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  36.63 
 
 
517 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  36.99 
 
 
512 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  47.29 
 
 
476 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  36.47 
 
 
512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 
509 aa  326  5e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  36.59 
 
 
511 aa  327  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  36.59 
 
 
512 aa  326  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  35.98 
 
 
509 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  36.59 
 
 
512 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  36.56 
 
 
513 aa  323  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  45.31 
 
 
513 aa  322  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.75 
 
 
495 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  34.48 
 
 
499 aa  307  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  34.65 
 
 
489 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  34.02 
 
 
486 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  30.36 
 
 
502 aa  252  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  40.74 
 
 
333 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  38.22 
 
 
483 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  30.3 
 
 
476 aa  224  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  30.3 
 
 
476 aa  224  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  31.2 
 
 
499 aa  209  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.71 
 
 
505 aa  208  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.92 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  37.1 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.98 
 
 
500 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  34.97 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.71 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.33 
 
 
506 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  34.84 
 
 
487 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.43 
 
 
501 aa  178  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.43 
 
 
518 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  27.22 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.41 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25.38 
 
 
511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.67 
 
 
496 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  30.96 
 
 
510 aa  172  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  32.13 
 
 
438 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  30.16 
 
 
514 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.15 
 
 
490 aa  167  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.78 
 
 
512 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.06 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.06 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.6 
 
 
538 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.65 
 
 
489 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  31 
 
 
508 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  32.15 
 
 
501 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.25 
 
 
514 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 
503 aa  160  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  30.47 
 
 
511 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.96 
 
 
515 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.08 
 
 
512 aa  159  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.14 
 
 
502 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.61 
 
 
484 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  26.53 
 
 
506 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  30.72 
 
 
494 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.31 
 
 
517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.15 
 
 
504 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.97 
 
 
509 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  30.31 
 
 
517 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.34 
 
 
506 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.21 
 
 
511 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.49 
 
 
499 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.21 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.99 
 
 
472 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.9 
 
 
497 aa  153  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  31.87 
 
 
494 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  31.66 
 
 
494 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.46 
 
 
509 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  31.66 
 
 
494 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.18 
 
 
505 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.04 
 
 
505 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  30.99 
 
 
483 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  32.31 
 
 
481 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  28.26 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  31.73 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>