More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1318 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
408 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  50.12 
 
 
576 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
589 aa  312  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
625 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.65 
 
 
1010 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
920 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
682 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1203 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  44.18 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  42.03 
 
 
549 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
579 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  44.44 
 
 
553 aa  176  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
569 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  41.44 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  32.54 
 
 
1364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  43.51 
 
 
423 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
885 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
555 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  30.93 
 
 
1287 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1560 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
637 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
944 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
572 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
1039 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
594 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
492 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  33.82 
 
 
599 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
618 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1158 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
597 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
581 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
1548 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
423 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
582 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  32.86 
 
 
1353 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
489 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
903 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  36.92 
 
 
470 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
600 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.17 
 
 
1629 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.81 
 
 
1348 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
827 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
458 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
712 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
609 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
554 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  32.49 
 
 
762 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
815 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  28.35 
 
 
608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  34.66 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
437 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
1042 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
585 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
566 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
590 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
725 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
3470 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
584 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
652 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
608 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
596 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
519 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  36.25 
 
 
560 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
608 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 
833 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
880 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  34.88 
 
 
589 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  31.99 
 
 
484 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  31.64 
 
 
771 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  39.02 
 
 
600 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  31.64 
 
 
771 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1021 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
575 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
718 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  37.94 
 
 
508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
612 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
755 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
695 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
781 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
2153 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
440 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
591 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
634 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
663 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  28.94 
 
 
610 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
771 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
771 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
772 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
758 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
771 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  34.71 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
1068 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
2161 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>