40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0404 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 443 aa  894    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4557  hypothetical protein  51.93 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5416  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  25.59 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0286038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  24.4 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  21.87 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25.71 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  26.32 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.9 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  24.35 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.85 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.25 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  23.3 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  25.48 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  24.41 
 
 		 507 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  23.24 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.27 
 
 		 516 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  20.54 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  23.01 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 532 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3069  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  40 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  39.71 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  50.88 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  21.84 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  23.67 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  26.19 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  47.37 
 
 		 516 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  24.18 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 722 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  50.88 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  46.77 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1727  UDP-galactopyranose mutase  25.81 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0324536  normal  0.111313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2024  UDP-galactopyranose mutase  21.66 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  42.31 
 
 		 245 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  47.37 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  43.1 
 
 		 507 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  23.32 
 
 		 783 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  21.62 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  32.5 
 
 		 373 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>