More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2170 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  100 
 
 		 303 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  31.38 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  26.09 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.04 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  30.91 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  28.5 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.77 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 572 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  36.64 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  32.68 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.1 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.42 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.86 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  32.41 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.33 
 
 		 672 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  25.25 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  27.17 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.25 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.49 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  34.27 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.53 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  24.9 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  30.77 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  25.61 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.32 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  27.52 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  23.17 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.09 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30.19 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  33.04 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.31 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.43 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.3 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.58 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  31.41 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.61 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0908  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase /2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  30.36 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.25 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.17 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.67 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1007  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.29 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.19 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  29.81 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.19 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  24.32 
 
 		 444 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 236 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 247 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 247 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.19 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 240 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.4 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.86 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862077  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 232 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.51 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.18 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0897  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.53 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3011  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  normal  0.0163533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.61 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  24.19 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>