159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1483 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1483  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  100 
 
 		 332 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.307575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  72.21 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1862  phosphatidylserine decarboxylase-related  65.76 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  64.62 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2685  phosphatidylserine decarboxylase-related  64.02 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2301  phosphatidylserine decarboxylase  63.25 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  57.49 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  29.63 
 
 		 1264 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 		 1064 aa  102  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  26.8 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  28.43 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  27.4 
 
 		 301 aa  89.7  7e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  28.04 
 
 		 1053 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  31.15 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  28.27 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.72 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  25.93 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  29.46 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  33.52 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  26.67 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  30.25 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  23.01 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  24.6 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  28.77 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  27.03 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  26.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  28.99 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  26.64 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  26.17 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  29.21 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  27.48 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  26.07 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  25.94 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  27.71 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  25.33 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.79 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  27.39 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  27.24 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  27.24 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  26.78 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  27.65 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  26.78 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  26.64 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  25.42 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  26.86 
 
 		 409 aa  67  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  27.17 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  27.87 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  27.48 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.9 
 
 		 613 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  28.03 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  24.52 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  24.52 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  30.81 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  24.52 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  24.52 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  26.85 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  25.51 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  29.57 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  29.82 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  24.51 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  26.92 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  28.65 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  23.24 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  23.24 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  23.24 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  23.24 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  23.24 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  26.78 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  25.68 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  26.85 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  22.82 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  22.5 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  23.65 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  24.43 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  23.24 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  29.63 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  29.21 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  30.38 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  28.99 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  29.22 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  26 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  26.51 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  26.4 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  25.35 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>