37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1316 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  100 
 
 		 148 aa  307  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  33.59 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  36.5 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  30.65 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  35.07 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  35.51 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  30.7 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  30.83 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  29.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  29.85 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2978  DNA polymerase beta domain protein region  32.03 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  33.67 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1252  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.859255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  30.83 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  27.94 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  29.6 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  26.19 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  36.19 
 
 		 271 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  32.41 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  29.2 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  32.56 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2281  nucleotidyltransferase  30.69 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  30.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  29.7 
 
 		 135 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5679  putative nucleotidyltransferase  29.7 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0666104  decreased coverage  0.000482275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  30.4 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3028  hypothetical protein  51.16 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0421336  normal  0.501717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3165  hypothetical protein  35.37 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>