216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3278 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
363 aa  721    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  67.95 
 
 
364 aa  501  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  69.63 
 
 
398 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  69.59 
 
 
368 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  69.04 
 
 
368 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  69.08 
 
 
398 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  67.12 
 
 
365 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  58.38 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  54.1 
 
 
369 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  53.61 
 
 
386 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  50.95 
 
 
380 aa  345  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  53.33 
 
 
378 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  50.68 
 
 
380 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  52.17 
 
 
377 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  51.01 
 
 
371 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  51.23 
 
 
383 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  50.55 
 
 
392 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  52.15 
 
 
370 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
373 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  48.85 
 
 
401 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 
373 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  48.34 
 
 
378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
373 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
374 aa  328  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  52.79 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  48.28 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  48.48 
 
 
369 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
376 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  50.43 
 
 
378 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
367 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  50.87 
 
 
371 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.68 
 
 
372 aa  322  7e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  47.43 
 
 
369 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  50.83 
 
 
374 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  47.34 
 
 
377 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  48.37 
 
 
386 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  47.65 
 
 
370 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  46.51 
 
 
371 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  46.58 
 
 
366 aa  315  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  47.15 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  49 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
369 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  48.13 
 
 
357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  47.15 
 
 
369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  47.06 
 
 
375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  47.06 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  48.89 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.34 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 
367 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  48.13 
 
 
368 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
365 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  46.13 
 
 
391 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  47.55 
 
 
380 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  47.96 
 
 
367 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  47.35 
 
 
392 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  47.08 
 
 
394 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  48.28 
 
 
413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.2 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 
377 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  46.98 
 
 
376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  47.57 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  47.19 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  47.06 
 
 
373 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  47.19 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  46.45 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  49.44 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  47.28 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  47.73 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  45.78 
 
 
377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  48.36 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
397 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  47.59 
 
 
381 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  46.61 
 
 
385 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 
401 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  49.57 
 
 
374 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
397 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
401 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
400 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
400 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
394 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  45.79 
 
 
401 aa  298  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  46.86 
 
 
361 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  46.05 
 
 
372 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  46.05 
 
 
372 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  45.45 
 
 
378 aa  296  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  45.56 
 
 
365 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  43.6 
 
 
382 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  47.24 
 
 
367 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  45.53 
 
 
369 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>