211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2581 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  100 
 
 
339 aa  704    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  36.26 
 
 
340 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  35.24 
 
 
349 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  32.01 
 
 
360 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  34.43 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  33.74 
 
 
340 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  30.72 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  31.18 
 
 
338 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  30.38 
 
 
360 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  29.3 
 
 
355 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  29.6 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.03 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  25.82 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  29.52 
 
 
258 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 
350 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.48 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.89 
 
 
257 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31363  predicted protein  25.32 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0616493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  26.19 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.51 
 
 
353 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.66 
 
 
281 aa  59.3  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  24.88 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  27.14 
 
 
259 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.73 
 
 
472 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  24.78 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0878  histone-like DNA-binding protein  24.88 
 
 
249 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147294  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  27.45 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.84 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.84 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.18 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  27.45 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.38 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  25.96 
 
 
256 aa  54.3  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.66 
 
 
250 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.19 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  24.54 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00367255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.15 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.09 
 
 
300 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  26.83 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  27.06 
 
 
255 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.05 
 
 
262 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  25.85 
 
 
255 aa  52.8  0.000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.57 
 
 
257 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.57 
 
 
257 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
327 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  27.32 
 
 
258 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.45 
 
 
348 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.49 
 
 
340 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.07 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  22.55 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08227  chromosome partitioning protein ParA  27.86 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000521031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
259 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2774  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.76 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  28.8 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.87 
 
 
366 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  25.23 
 
 
257 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
265 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  24.09 
 
 
330 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 
263 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  26.57 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  23.21 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.73 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.7 
 
 
276 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.63 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.25 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 
282 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.84 
 
 
257 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.24 
 
 
264 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  24.62 
 
 
370 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.77 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  25.58 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.17 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.49 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5868  replication-associated protein  24.58 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>