More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1389 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  57.63 
 
 		 550 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  80.77 
 
 		 552 aa  947    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  61.15 
 
 		 549 aa  682    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  63.22 
 
 		 544 aa  749    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  55.66 
 
 		 566 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  57.67 
 
 		 550 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  57.78 
 
 		 552 aa  674    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  70.44 
 
 		 560 aa  849    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  56.09 
 
 		 566 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  83.58 
 
 		 552 aa  977    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  100 
 
 		 549 aa  1140    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  54.13 
 
 		 566 aa  643    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  55.93 
 
 		 571 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  59.59 
 
 		 547 aa  677    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  78.1 
 
 		 552 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  76.05 
 
 		 549 aa  918    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  57.06 
 
 		 548 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  56.16 
 
 		 548 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  56.93 
 
 		 568 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  76.78 
 
 		 549 aa  924    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  55.72 
 
 		 550 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  56.12 
 
 		 549 aa  662    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  60.44 
 
 		 549 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  61.43 
 
 		 554 aa  737    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  60.07 
 
 		 549 aa  673    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  57.09 
 
 		 553 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  56.5 
 
 		 550 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  55.09 
 
 		 549 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  56.69 
 
 		 843 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  54.16 
 
 		 546 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  52.21 
 
 		 562 aa  621  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  53.66 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  55.72 
 
 		 572 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  53.79 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  53.07 
 
 		 578 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  52.89 
 
 		 578 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  50.86 
 
 		 605 aa  611  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  53.01 
 
 		 560 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  53.01 
 
 		 601 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  53.44 
 
 		 577 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  53.19 
 
 		 579 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  51.85 
 
 		 575 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  54.18 
 
 		 577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  51.85 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  53.05 
 
 		 546 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  50.37 
 
 		 564 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  50.19 
 
 		 562 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  50.64 
 
 		 576 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  50 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  50.55 
 
 		 576 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  51.48 
 
 		 575 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 		 564 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  52.31 
 
 		 576 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  51.66 
 
 		 579 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  51.48 
 
 		 575 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  50.74 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  51.11 
 
 		 576 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  51.76 
 
 		 552 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  52.68 
 
 		 576 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  52.5 
 
 		 576 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  51.3 
 
 		 575 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  51.48 
 
 		 575 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  51.48 
 
 		 575 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  51.49 
 
 		 565 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  50.93 
 
 		 576 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  50.93 
 
 		 576 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  50 
 
 		 578 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  50.93 
 
 		 576 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  50.93 
 
 		 576 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  50.93 
 
 		 576 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  53 
 
 		 563 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  50.93 
 
 		 570 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 		 576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  49.81 
 
 		 570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  49.81 
 
 		 557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  48.88 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  51.01 
 
 		 551 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 		 546 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  48.8 
 
 		 571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  48.98 
 
 		 571 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  50.18 
 
 		 596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  50 
 
 		 561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  50.92 
 
 		 544 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  51.02 
 
 		 574 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  48.52 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  48.61 
 
 		 571 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  48.8 
 
 		 565 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  49.63 
 
 		 562 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  49.45 
 
 		 584 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  50.46 
 
 		 570 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  48.14 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  51.02 
 
 		 828 aa  566  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 		 574 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  48.9 
 
 		 602 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 		 570 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>