More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0056 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  805    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  64.02 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  62.01 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  61.98 
 
 		 415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  49.63 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 441 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 418 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  33.45 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  30.1 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  25 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.32 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.44 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 421 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  29.43 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  29.06 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  27.2 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  30.58 
 
 		 437 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  30.58 
 
 		 437 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  23.41 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.41 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  28.18 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  31.66 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  34.27 
 
 		 493 aa  109  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  31.09 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.3 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.3 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.65 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.43 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.43 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.43 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.93 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22.64 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.59 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22.31 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 436 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 427 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  27.07 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  25.38 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.07 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  22.74 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  26.84 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  26.72 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  26.79 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  23.76 
 
 		 452 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  23.76 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  27.75 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  26.72 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  30.94 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>