59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1654 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 179 aa  355  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 		 237 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  42.98 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  35.04 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 370 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 237 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.04 
 
 		 356 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 378 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 212 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 412 aa  44.3  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 440 aa  44.3  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.39 
 
 		 378 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.96 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 402 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 177 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 212 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 213 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  41.07 
 
 		 192 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.13 
 
 		 369 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.78 
 
 		 382 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 261 aa  41.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 261 aa  41.2  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>